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Moyens à la recherche - Laboratoire d'Océanographie de Villefranche-sur-Mer
Unité Mixte de Recherche 7093 – CNRS/UPMC

Tutelles

UPMC

UPMC

CNRS
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Plateforme Cytométrie

Cytométrie en Flux

 

Le LOV possède deux cytomètres en flux Becton Dickinson, le FACS Calibur et l’ACCURI C6, utilisés dans le cadre de recherches liées à l’océanographie.

 

Les activités courantes concernent le suivi in situ de l’évolution saisonnière des populations de l’ultraphytoplancton, des procaryotes hétérotrophes et des virus marins en vue d’une compréhension de la structure du réseau microbien (majoritairement constitué d’organismes unicellulaires inférieurs à 2 µm) et leur rôle dans la biogéochimie du carbone. La cytométrie est aussi utilisée dans le cadre de suivi de culture de microorganismes (dénombrement, cycle cellulaire, viabilité cellulaire, etc…)

EquipementS

BD FACS Calibur

 BD FACS Calibur

Le BD FACS Calibur est un cytomètre de paillasse, équipé d’un laser et de 5 détecteurs :

    • un laser Argon d'excitation à 488nm (bleu)
    • un PMT avec filtre pour mesurer l'émission à 530nm : FL1
    • un PMT avec filtre pour mesurer l'émission à 585nm : FL2
    • un PMT avec filtre pour mesurer l'émission de longueur d'onde > 670nm : FL3
    • un capteur d'indice de taille : FSC
    • un capteur d'indice de granulosité : SSC

 La taille de la buse d’aspiration est de 70µm et les trois vitesses de flux sont respectivement de 19 ; 35 et 60µl/min.

Le logiciel Cell Quest Pro 6.0 pour Macintosh est utilisé pour l’acquisition et l’analyse des données.

BD ACCURI C6

 BD ACCURI C6

Le BD ACCURI C6 est un cytomètre transportable et est équipé de deux lasers et de 6 détecteurs :

    • un laser d'excitation à 488nm (bleu)
    • un laser d'excitation à 640nm (rouge)
    • un PMT avec filtre pour mesurer l'émission à 530nm : FL1
    • un PMT avec filtre pour mesurer l'émission à 585nm : FL2
    • un PMT avec filtre pour mesurer l'émission de longueur d'onde > 670nm : FL3
    • un PMT avec filtre pour mesurer l'émission à 675nm : FL4
    • un capteur d'indice de taille : FSC
    • un capteur d'indice de granulosité : SSC

NB : Seule la FL4 est obtenue avec le laser à 640nm.

Il est aussi équipé d’un passeur d’échantillon (plaque à puits).

Le logiciel d’acquisition et d’analyse est le BD CSampler Software.

 

Contacts

FACS Calibur

 

Maria Luiza Pedrotti : responsable scientifique

Sophie Marro : responsable technique

ACCURI C6

 

Sophie Rabouille : responsable scientifique

Amélie Talec : responsable technique

LOV - 06/08/14